Che cos'è tooluniverse-spatial-transcriptomics?
Analizza i dati di trascrittomica spaziale per mappare l'espressione genica nell'architettura dei tessuti. Supporta 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seq e piattaforme basate su imaging. Esegue il clustering spaziale, l'identificazione dei domini, l'analisi di prossimità cellula-cellula, i modelli di espressione genica spaziale, la mappatura dell'architettura dei tessuti e l'integrazione con i dati di una singola cellula. Utilizzare durante l'analisi di set di dati di trascrittomica spaziale, lo studio dell'organizzazione dei tessuti, l'identificazione di modelli di espressione spaziale, la mappatura delle interazioni cellula-cellula nel contesto del tessuto, la caratterizzazione della struttura spaziale del microambiente tumorale o l'integrazione di dati RNA-seq spaziali e di singole cellule per un'analisi completa dei tessuti. Fonte: mims-harvard/tooluniverse.