Was ist tooluniverse-spatial-transcriptomics?
Analysieren Sie räumliche Transkriptomdaten, um die Genexpression in der Gewebearchitektur abzubilden. Unterstützt 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seq und bildbasierte Plattformen. Führt räumliches Clustering, Domänenidentifizierung, Zell-Zell-Proximity-Analyse, räumliche Genexpressionsmuster, Kartierung der Gewebearchitektur und Integration mit Einzelzelldaten durch. Zur Verwendung bei der Analyse räumlicher Transkriptomik-Datensätze, der Untersuchung der Gewebeorganisation, der Identifizierung räumlicher Expressionsmuster, der Kartierung von Zell-Zell-Interaktionen im Gewebekontext, der Charakterisierung der räumlichen Struktur der Tumormikroumgebung oder der Integration räumlicher und Einzelzell-RNA-seq-Daten für eine umfassende Gewebeanalyse. Quelle: mims-harvard/tooluniverse.