Qu'est-ce que tooluniverse-spatial-transcriptomics ?
Analysez les données de transcriptomique spatiale pour cartographier l’expression des gènes dans l’architecture tissulaire. Prend en charge les plates-formes 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seq et basées sur l'imagerie. Effectue le regroupement spatial, l'identification de domaine, l'analyse de proximité cellule-cellule, les modèles d'expression génique spatiale, la cartographie de l'architecture tissulaire et l'intégration avec des données unicellulaires. À utiliser pour analyser des ensembles de données de transcriptomique spatiale, étudier l'organisation des tissus, identifier des modèles d'expression spatiale, cartographier les interactions cellule-cellule dans un contexte tissulaire, caractériser la structure spatiale du microenvironnement tumoral ou intégrer des données de séquençage d'ARN spatiales et unicellulaires pour une analyse complète des tissus. Source : mims-harvard/tooluniverse.