tooluniverse-multi-omics-integration

Coordinate and integrate multiple omics datasets for comprehensive systems biology analysis. This skill orchestrates specialized ToolUniverse skills to perform cross-omics correlation, multi-omics clustering, pathway-level integration, and unified interpretation across molecular layers.

| Data Integration | Match samples across omics, handle missing data, normalize scales | | Cross-Omics Correlation | Correlate features across molecular layers (gene expression vs protein, methylation vs expression) | | Multi-Omics Clustering | MOFA+, NMF, joint clustering to identify omics-driven subtypes |

| Pathway Integration | Combine omics evidence at pathway level for unified biological interpretation | | Biomarker Discovery | Identify multi-omics signatures with improved predictive power | | Skill Coordination | Orchestrate RNA-seq, epigenomics, variant-analysis, protein-interactions, gene-enrichment skills |

Integre y analice múltiples conjuntos de datos ómicos (transcriptómica, proteómica, epigenómica, genómica, metabolómica) para biología de sistemas y medicina de precisión. Realiza correlación cruzada, agrupación multiómica (MOFA+, NMF), integración a nivel de ruta y comparación de muestras. Coordina las habilidades de ToolUniverse para datos de expresión (RNA-seq), epigenómica (metilación, ChIP-seq), variantes (SNV, CNV), interacciones de proteínas y enriquecimiento de vías. Úselo al analizar conjuntos de datos multiómicos, realizar análisis integrativos, descubrir biomarcadores multiómicos, estudiar mecanismos de enfermedades en capas moleculares o realizar investigaciones de biología de sistemas que requieran un análisis coordinado de datos de transcriptoma, genoma, epigenoma, proteoma y metaboloma. Fuente: mims-harvard/tooluniverse.