Coordinate and integrate multiple omics datasets for comprehensive systems biology analysis. This skill orchestrates specialized ToolUniverse skills to perform cross-omics correlation, multi-omics clustering, pathway-level integration, and unified interpretation across molecular layers.
| Data Integration | Match samples across omics, handle missing data, normalize scales | | Cross-Omics Correlation | Correlate features across molecular layers (gene expression vs protein, methylation vs expression) | | Multi-Omics Clustering | MOFA+, NMF, joint clustering to identify omics-driven subtypes |
| Pathway Integration | Combine omics evidence at pathway level for unified biological interpretation | | Biomarker Discovery | Identify multi-omics signatures with improved predictive power | | Skill Coordination | Orchestrate RNA-seq, epigenomics, variant-analysis, protein-interactions, gene-enrichment skills |
دمج وتحليل مجموعات بيانات omics المتعددة (علم النسخ، وعلم البروتينات، وعلم اللاجينوم، وعلم الجينوم، وعلم التمثيل الغذائي) لبيولوجيا الأنظمة والطب الدقيق. ينفذ الارتباط عبر omics، وتجميع omics متعدد (MOFA+، NMF)، والتكامل على مستوى المسار، ومطابقة العينات. ينسق مهارات ToolUniverse لبيانات التعبير (RNA-seq)، وعلم الوراثة اللاجينية (مثيلة، وChIP-seq)، والمتغيرات (SNVs، وCNVs)، وتفاعلات البروتين، وإثراء المسار. يُستخدم عند تحليل مجموعات بيانات متعددة الأوميات، أو إجراء تحليل تكاملي، أو اكتشاف المؤشرات الحيوية متعددة الأوميات، أو دراسة آليات المرض عبر الطبقات الجزيئية، أو إجراء أبحاث بيولوجيا الأنظمة التي تتطلب تحليلًا منسقًا لبيانات النسخ والجينوم والإبيجينوم والبروتينات والأيض. المصدر: mims-harvard/tooluniverse.