tooluniverse-multi-omics-integration

Coordinate and integrate multiple omics datasets for comprehensive systems biology analysis. This skill orchestrates specialized ToolUniverse skills to perform cross-omics correlation, multi-omics clustering, pathway-level integration, and unified interpretation across molecular layers.

| Data Integration | Match samples across omics, handle missing data, normalize scales | | Cross-Omics Correlation | Correlate features across molecular layers (gene expression vs protein, methylation vs expression) | | Multi-Omics Clustering | MOFA+, NMF, joint clustering to identify omics-driven subtypes |

| Pathway Integration | Combine omics evidence at pathway level for unified biological interpretation | | Biomarker Discovery | Identify multi-omics signatures with improved predictive power | | Skill Coordination | Orchestrate RNA-seq, epigenomics, variant-analysis, protein-interactions, gene-enrichment skills |

Integrieren und analysieren Sie mehrere Omics-Datensätze (Transkriptomik, Proteomik, Epigenomik, Genomik, Metabolomik) für die Systembiologie und Präzisionsmedizin. Führt Cross-Omics-Korrelation, Multi-Omics-Clustering (MOFA+, NMF), Integration auf Pfadebene und Probenabgleich durch. Koordiniert ToolUniverse-Fähigkeiten für Expressionsdaten (RNA-seq), Epigenomik (Methylierung, ChIP-seq), Varianten (SNVs, CNVs), Proteininteraktionen und Signalweganreicherung. Zur Verwendung bei der Analyse von Multi-Omics-Datensätzen, der Durchführung integrativer Analysen, der Entdeckung von Multi-Omics-Biomarkern, der Untersuchung von Krankheitsmechanismen über molekulare Schichten hinweg oder der Durchführung systembiologischer Forschung, die eine koordinierte Analyse von Transkriptom-, Genom-, Epigenom-, Proteom- und Metabolomdaten erfordert. Quelle: mims-harvard/tooluniverse.