tooluniverse-multi-omics-integration

Coordinate and integrate multiple omics datasets for comprehensive systems biology analysis. This skill orchestrates specialized ToolUniverse skills to perform cross-omics correlation, multi-omics clustering, pathway-level integration, and unified interpretation across molecular layers.

| Data Integration | Match samples across omics, handle missing data, normalize scales | | Cross-Omics Correlation | Correlate features across molecular layers (gene expression vs protein, methylation vs expression) | | Multi-Omics Clustering | MOFA+, NMF, joint clustering to identify omics-driven subtypes |

| Pathway Integration | Combine omics evidence at pathway level for unified biological interpretation | | Biomarker Discovery | Identify multi-omics signatures with improved predictive power | | Skill Coordination | Orchestrate RNA-seq, epigenomics, variant-analysis, protein-interactions, gene-enrichment skills |

Интегрируйте и анализируйте несколько наборов данных омики (транскриптомика, протеомика, эпигеномика, геномика, метаболомика) для системной биологии и точной медицины. Выполняет перекрестную корреляцию, мультиомную кластеризацию (MOFA+, NMF), интеграцию на уровне путей и сопоставление образцов. Координирует навыки ToolUniverse для данных об экспрессии (RNA-seq), эпигеномике (метилирование, ChIP-seq), вариантах (SNV, CNV), взаимодействиях белков и обогащении путей. Используйте при анализе наборов данных мультиомики, выполнении интегративного анализа, обнаружении биомаркеров мультиомики, изучении механизмов заболеваний на разных молекулярных уровнях или проведении исследований в области системной биологии, требующих скоординированного анализа данных транскриптома, генома, эпигенома, протеома и метаболома. Источник: mims-harvard/tooluniverse.