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protein-qc

adaptyvbio/protein-design-skills

タンパク質設計のための品質管理メトリクスとフィルタリング閾値。このスキルは次の場合に使用します: (1) 結合、発現、または構造の設計品質の評価、(2) pLDDT、ipTM、PAE のフィルターしきい値の設定、(3) 配列負債のチェック (システイン、脱アミド化、多塩基クラスター)、(4) 多段階フィルター パイプラインの作成、(5) PyRosetta インターフェイス メトリクスの計算 (dG、SC、dSASA)、(6) 生物物理学的特性のチェック(不安定性、GRAVY、pI)、(7) 複合スコアを使用してデザインをランク付けします。 このスキルは、バインダー設計コンペや公開されたベンチマークからの研究に裏付けられたしきい値を提供します。

13インストール·0トレンド·@adaptyvbio

インストール

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill protein-qc

SKILL.md

Individual metrics have weak predictive power for binding. Research shows:

These thresholds filter out poor designs but do NOT predict binding affinity.

| Purpose | What it assesses | Key metrics |

タンパク質設計のための品質管理メトリクスとフィルタリング閾値。このスキルは次の場合に使用します: (1) 結合、発現、または構造の設計品質の評価、(2) pLDDT、ipTM、PAE のフィルターしきい値の設定、(3) 配列負債のチェック (システイン、脱アミド化、多塩基クラスター)、(4) 多段階フィルター パイプラインの作成、(5) PyRosetta インターフェイス メトリクスの計算 (dG、SC、dSASA)、(6) 生物物理学的特性のチェック(不安定性、GRAVY、pI)、(7) 複合スコアを使用してデザインをランク付けします。 このスキルは、バインダー設計コンペや公開されたベンチマークからの研究に裏付けられたしきい値を提供します。 ソース: adaptyvbio/protein-design-skills。

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引用可能な情報

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インストールコマンド
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill protein-qc
カテゴリ
</>開発ツール
認証済み
初回登録
2026-02-01
更新日
2026-02-18

クイックアンサー

protein-qc とは?

タンパク質設計のための品質管理メトリクスとフィルタリング閾値。このスキルは次の場合に使用します: (1) 結合、発現、または構造の設計品質の評価、(2) pLDDT、ipTM、PAE のフィルターしきい値の設定、(3) 配列負債のチェック (システイン、脱アミド化、多塩基クラスター)、(4) 多段階フィルター パイプラインの作成、(5) PyRosetta インターフェイス メトリクスの計算 (dG、SC、dSASA)、(6) 生物物理学的特性のチェック(不安定性、GRAVY、pI)、(7) 複合スコアを使用してデザインをランク付けします。 このスキルは、バインダー設計コンペや公開されたベンチマークからの研究に裏付けられたしきい値を提供します。 ソース: adaptyvbio/protein-design-skills。

protein-qc のインストール方法は?

ターミナルまたはコマンドラインツール(Terminal、iTerm、Windows Terminal など)を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill protein-qc インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code や Cursor で使用できるようになります

ソースリポジトリはどこですか?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills