·tooluniverse-single-cell
{}

tooluniverse-single-cell

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mims-harvard/tooluniverseGitHub: mims-harvard/tooluniverse출처: mims-harvard/tooluniverse

scanpy, anndata 및 scipy를 사용하여 생산 준비가 완료된 단일 세포 및 발현 매트릭스 분석. scRNA-seq QC, 정규화, PCA, UMAP, Leiden/Louvain 클러스터링, 차등 발현(Wilcoxon, t-test, DESeq2), 세포 유형 주석, 세포 유형별 통계 분석, 유전자 발현 상관 관계, 배치 수정(Harmony), 궤적 추론 및 세포-세포 통신 분석을 수행합니다. 새로운 기능: OmniPath(CellPhoneDB, CellChatDB)를 사용하여 세포 유형 간의 리간드-수용체 상호 작용을 분석하고, 통신 강도를 평가하고, 신호 전달 계통을 식별하고, 다중 하위 단위 수용체 복합체를 처리합니다. ToolUniverse 유전자 주석 도구(HPA, Ensembl, MyGene, UniProt) 및 강화 도구(gseapy, PANTHER, STRING)와 통합됩니다. h5ad, 10X, CSV/TSV 개수 행렬 및 사전 주석이 달린 데이터세트를 지원합니다. 단일 세포 RNA-seq 데이터 분석, 세포 간 상호 작용 연구, 세포 유형 차등 발현 수행, 세포 유형별 유전자 발현 상관 관계 계산, 종양-면역 통신 분석 또는 scRNA-seq 데이터 세트에 대한 질문에 답할 때 사용합니다.

mims-harvard·tooluniverse·single·cell
17설치·3트렌드·@mims-harvard

설치

GitHub: mims-harvard/tooluniverse
$npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-single-cell

tooluniverse-single-cell 설치 방법

명령줄에서 tooluniverse-single-cell AI 스킬을 개발 환경에 빠르게 설치

  1. 터미널 열기: 터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다
  2. 설치 명령어 실행: 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-single-cell
  3. 설치 확인: 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code, Cursor, OpenClaw에서 사용할 수 있습니다

출처: mims-harvard/tooluniverse.

SKILL.md

원본 보기

Comprehensive single-cell RNA-seq analysis and expression matrix processing using scanpy, anndata, scipy, and ToolUniverse.

BixBench Coverage: 18+ questions across 5 projects (bix-22, bix-27, bix-31, bix-33, bix-36)

Install: pip install scanpy anndata leidenalg umap-learn harmonypy gseapy pandas numpy scipy scikit-learn statsmodels

scanpy, anndata 및 scipy를 사용하여 생산 준비가 완료된 단일 세포 및 발현 매트릭스 분석. scRNA-seq QC, 정규화, PCA, UMAP, Leiden/Louvain 클러스터링, 차등 발현(Wilcoxon, t-test, DESeq2), 세포 유형 주석, 세포 유형별 통계 분석, 유전자 발현 상관 관계, 배치 수정(Harmony), 궤적 추론 및 세포-세포 통신 분석을 수행합니다. 새로운 기능: OmniPath(CellPhoneDB, CellChatDB)를 사용하여 세포 유형 간의 리간드-수용체 상호 작용을 분석하고, 통신 강도를 평가하고, 신호 전달 계통을 식별하고, 다중 하위 단위 수용체 복합체를 처리합니다. ToolUniverse 유전자 주석 도구(HPA, Ensembl, MyGene, UniProt) 및 강화 도구(gseapy, PANTHER, STRING)와 통합됩니다. h5ad, 10X, CSV/TSV 개수 행렬 및 사전 주석이 달린 데이터세트를 지원합니다. 단일 세포 RNA-seq 데이터 분석, 세포 간 상호 작용 연구, 세포 유형 차등 발현 수행, 세포 유형별 유전자 발현 상관 관계 계산, 종양-면역 통신 분석 또는 scRNA-seq 데이터 세트에 대한 질문에 답할 때 사용합니다. 출처: mims-harvard/tooluniverse.

인용 가능한 정보

AI/검색 인용용 안정적인 필드와 명령어.

설치 명령어
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-single-cell
출처
mims-harvard/tooluniverse
카테고리
{}데이터 분석
인증됨
✓
최초 등록
2026-03-09
업데이트
2026-03-11
URL
https://www.learn-skills.dev/ko/skills/mims-harvard/tooluniverse/tooluniverse-single-cell

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빠른 답변

tooluniverse-single-cell이란?

scanpy, anndata 및 scipy를 사용하여 생산 준비가 완료된 단일 세포 및 발현 매트릭스 분석. scRNA-seq QC, 정규화, PCA, UMAP, Leiden/Louvain 클러스터링, 차등 발현(Wilcoxon, t-test, DESeq2), 세포 유형 주석, 세포 유형별 통계 분석, 유전자 발현 상관 관계, 배치 수정(Harmony), 궤적 추론 및 세포-세포 통신 분석을 수행합니다. 새로운 기능: OmniPath(CellPhoneDB, CellChatDB)를 사용하여 세포 유형 간의 리간드-수용체 상호 작용을 분석하고, 통신 강도를 평가하고, 신호 전달 계통을 식별하고, 다중 하위 단위 수용체 복합체를 처리합니다. ToolUniverse 유전자 주석 도구(HPA, Ensembl, MyGene, UniProt) 및 강화 도구(gseapy, PANTHER, STRING)와 통합됩니다. h5ad, 10X, CSV/TSV 개수 행렬 및 사전 주석이 달린 데이터세트를 지원합니다. 단일 세포 RNA-seq 데이터 분석, 세포 간 상호 작용 연구, 세포 유형 차등 발현 수행, 세포 유형별 유전자 발현 상관 관계 계산, 종양-면역 통신 분석 또는 scRNA-seq 데이터 세트에 대한 질문에 답할 때 사용합니다. 출처: mims-harvard/tooluniverse.

tooluniverse-single-cell 설치 방법은?

터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-single-cell 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code, Cursor, OpenClaw에서 사용할 수 있습니다

소스 저장소는 어디인가요?

https://github.com/mims-harvard/tooluniverse

상세

카테고리
{}데이터 분석
출처
skills.sh
최초 등록
2026-03-09

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