single-cell-rna-qc

SKILL.md

Automated QC workflow for single-cell RNA-seq data following scverse best practices.

Default recommendation: Use Approach 1 (complete pipeline) unless the user has specific custom requirements or explicitly requests non-standard filtering logic.

For standard QC following scverse best practices, use the convenience script scripts/qcanalysis.py:

Realiza control de calidad en datos de RNA-seq unicelulares (archivos .h5ad o .h5) utilizando las mejores prácticas scverse con filtrado basado en MAD y visualizaciones integrales. Úselo cuando los usuarios soliciten análisis de control de calidad, filtren celdas de baja calidad, evalúen la calidad de los datos o sigan las mejores prácticas scverse/scanpy para el análisis de una sola celda. Fuente: anthropics/life-sciences.

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