·pdb

从 RCSB PDB 中获取并分析蛋白质结构。在以下情况下使用此技能:(1) 需要通过 PDB ID 下载结构,(2) 搜索相似的结构,(3) 为活页夹设计准备目标,(4) 提取特定的链或域,(5) 获取结构元数据。 对于序列查找,请使用 uniprot。对于活页夹设计工作流程,请使用活页夹设计。

13安装·0热度·@adaptyvbio

安装

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb

SKILL.md

Note: This skill uses the RCSB PDB web API directly. No Modal deployment needed - all operations run locally via HTTP requests.

Structure not found: Check PDB ID format (4 characters) Multiple models: Select first model for design Missing residues: Check for gaps in structure

Next: Use structure with boltzgen (recommended) or rfdiffusion for design.

从 RCSB PDB 中获取并分析蛋白质结构。在以下情况下使用此技能:(1) 需要通过 PDB ID 下载结构,(2) 搜索相似的结构,(3) 为活页夹设计准备目标,(4) 提取特定的链或域,(5) 获取结构元数据。 对于序列查找,请使用 uniprot。对于活页夹设计工作流程,请使用活页夹设计。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。

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可引用信息

为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。

安装命令
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb
分类
>_效率工具
认证
收录时间
2026-02-01
更新时间
2026-02-18

快速解答

什么是 pdb?

从 RCSB PDB 中获取并分析蛋白质结构。在以下情况下使用此技能:(1) 需要通过 PDB ID 下载结构,(2) 搜索相似的结构,(3) 为活页夹设计准备目标,(4) 提取特定的链或域,(5) 获取结构元数据。 对于序列查找,请使用 uniprot。对于活页夹设计工作流程,请使用活页夹设计。 来源:adaptyvbio/protein-design-skills。

如何安装 pdb?

打开你的终端或命令行工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 复制并运行以下命令:npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb 安装完成后,技能将自动配置到你的 AI 编程环境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用

这个 Skill 的源码在哪?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills