·pdb

Récupérez et analysez les structures protéiques de RCSB PDB. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Vous devez télécharger une structure par ID PDB, (2) Rechercher des structures similaires, (3) Préparer la cible pour la conception du classeur, (4) Extraire des chaînes ou des domaines spécifiques, (5) Obtenir des métadonnées de structure. Pour la recherche de séquence, utilisez uniprot. Pour le flux de travail de conception de classeur, utilisez binder-design.

13Installations·0Tendance·@adaptyvbio

Installation

$npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb

SKILL.md

Note: This skill uses the RCSB PDB web API directly. No Modal deployment needed - all operations run locally via HTTP requests.

Structure not found: Check PDB ID format (4 characters) Multiple models: Select first model for design Missing residues: Check for gaps in structure

Next: Use structure with boltzgen (recommended) or rfdiffusion for design.

Récupérez et analysez les structures protéiques de RCSB PDB. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Vous devez télécharger une structure par ID PDB, (2) Rechercher des structures similaires, (3) Préparer la cible pour la conception du classeur, (4) Extraire des chaînes ou des domaines spécifiques, (5) Obtenir des métadonnées de structure. Pour la recherche de séquence, utilisez uniprot. Pour le flux de travail de conception de classeur, utilisez binder-design. Source : adaptyvbio/protein-design-skills.

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Faits (prêts à citer)

Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.

Commande d'installation
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb
Catégorie
>_Productivité
Vérifié
Première apparition
2026-02-01
Mis à jour
2026-02-18

Réponses rapides

Qu'est-ce que pdb ?

Récupérez et analysez les structures protéiques de RCSB PDB. Utilisez cette compétence lorsque : (1) Vous devez télécharger une structure par ID PDB, (2) Rechercher des structures similaires, (3) Préparer la cible pour la conception du classeur, (4) Extraire des chaînes ou des domaines spécifiques, (5) Obtenir des métadonnées de structure. Pour la recherche de séquence, utilisez uniprot. Pour le flux de travail de conception de classeur, utilisez binder-design. Source : adaptyvbio/protein-design-skills.

Comment installer pdb ?

Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code ou Cursor

Où se trouve le dépôt source ?

https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills