RCSB PDB からタンパク質構造を取得して分析します。このスキルは、(1) PDB ID によって構造をダウンロードする必要がある場合、(2) 類似の構造を検索する場合、(3) バインダー設計のターゲットを準備する場合、(4) 特定のチェーンまたはドメインを抽出する場合、(5) 構造メタデータを取得する場合に使用します。 配列の検索には、uniprot を使用します。バインダー デザインのワークフローには、binder-design を使用します。
SKILL.md
Note: This skill uses the RCSB PDB web API directly. No Modal deployment needed - all operations run locally via HTTP requests.
Structure not found: Check PDB ID format (4 characters) Multiple models: Select first model for design Missing residues: Check for gaps in structure
Next: Use structure with boltzgen (recommended) or rfdiffusion for design.
RCSB PDB からタンパク質構造を取得して分析します。このスキルは、(1) PDB ID によって構造をダウンロードする必要がある場合、(2) 類似の構造を検索する場合、(3) バインダー設計のターゲットを準備する場合、(4) 特定のチェーンまたはドメインを抽出する場合、(5) 構造メタデータを取得する場合に使用します。 配列の検索には、uniprot を使用します。バインダー デザインのワークフローには、binder-design を使用します。 ソース: adaptyvbio/protein-design-skills。
引用可能な情報
AI/検索での引用用の安定したフィールドとコマンド。
- インストールコマンド
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb- カテゴリ
- >_生産性
- 認証済み
- ✓
- 初回登録
- 2026-02-01
- 更新日
- 2026-02-18
クイックアンサー
pdb とは？
RCSB PDB からタンパク質構造を取得して分析します。このスキルは、(1) PDB ID によって構造をダウンロードする必要がある場合、(2) 類似の構造を検索する場合、(3) バインダー設計のターゲットを準備する場合、(4) 特定のチェーンまたはドメインを抽出する場合、(5) 構造メタデータを取得する場合に使用します。 配列の検索には、uniprot を使用します。バインダー デザインのワークフローには、binder-design を使用します。 ソース: adaptyvbio/protein-design-skills。
pdb のインストール方法は？
ターミナルまたはコマンドラインツール（Terminal、iTerm、Windows Terminal など）を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill pdb インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code や Cursor で使用できるようになります
ソースリポジトリはどこですか？
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills
詳細
- カテゴリ
- >_生産性
- ソース
- skills.sh
- 初回登録
- 2026-02-01