bindcraft

| Python | 3.9+ | 3.10 | | CUDA | 11.7+ | 12.0+ | | GPU VRAM | 32GB | 48GB (L40S) | | RAM | 32GB | 64GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --target-pdb | required | path | Target structure | | --target-chain | required | A-Z | Target chain(s) | | --binder-lengths | 70-100 | 40-150 | Length range | | --hotspots | None | residues | Target hotspots | | --num-designs | 50 | 1-500 | Number of designs | | --protocol | default | fast/default/slow | Quality vs speed |

Комплексный дизайн переплета с использованием галлюцинации BindCraft. Используйте этот навык, когда: (1) разрабатываете связующие белки со встроенной проверкой AF2, (2) проводите кампании по связям производственного качества, (3) используете различные протоколы проектирования (быстрый, по умолчанию, медленный), (4) требуется совместная оптимизация основной цепи и последовательности, (5) хотите получить высокий уровень успеха экспериментов. Для генерации только магистральной сети используйте RFDiffusion. Для порогов контроля качества используйте белок-QC. Для руководства по выбору инструмента используйте Binder-Design. Источник: adaptyvbio/protein-design-skills.