bindcraft

SKILL.md

| Python | 3.9+ | 3.10 | | CUDA | 11.7+ | 12.0+ | | GPU VRAM | 32GB | 48GB (L40S) | | RAM | 32GB | 64GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --target-pdb | required | path | Target structure | | --target-chain | required | A-Z | Target chain(s) | | --binder-lengths | 70-100 | 40-150 | Length range | | --hotspots | None | residues | Target hotspots | | --num-designs | 50 | 1-500 | Number of designs | | --protocol | default | fast/default/slow | Quality vs speed |

BindCraft 幻覚を使用したエンドツーエンドのバインダー設計。このスキルは、(1) AF2 検証が組み込まれたタンパク質バインダーを設計する場合、(2) 実稼働品質のバインダー キャンペーンを実行する場合、(3) 異なる設計プロトコル (高速、デフォルト、低速) を使用する場合、(4) ジョイント バックボーンと配列の最適化が必要な場合、(5) 高い実験成功率が必要な場合に使用します。 バックボーンのみの生成には、rfdifffusion を使用します。 QC しきい値には、protein-qc を使用します。ツール選択のガイダンスについては、binder-design を使用してください。 ソース: adaptyvbio/protein-design-skills。

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