bindcraft

| Python | 3.9+ | 3.10 | | CUDA | 11.7+ | 12.0+ | | GPU VRAM | 32GB | 48GB (L40S) | | RAM | 32GB | 64GB |

First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.

| --target-pdb | required | path | Target structure | | --target-chain | required | A-Z | Target chain(s) | | --binder-lengths | 70-100 | 40-150 | Length range | | --hotspots | None | residues | Target hotspots | | --num-designs | 50 | 1-500 | Number of designs | | --protocol | default | fast/default/slow | Quality vs speed |

تصميم الموثق الشامل باستخدام هلوسة BindCraft. استخدم هذه المهارة عندما: (1) تصميم روابط البروتين مع التحقق من صحة AF2 المدمج، (2) تشغيل حملات ربط جودة الإنتاج، (3) استخدام بروتوكولات تصميم مختلفة (سريعة، افتراضية، بطيئة)، (4) تحتاج إلى العمود الفقري المشترك وتحسين التسلسل، (5) تريد معدل نجاح تجريبي مرتفع. لتوليد العمود الفقري فقط، استخدم rfdiffusion. لعتبات مراقبة الجودة، استخدم البروتين لمراقبة الجودة. للحصول على إرشادات حول اختيار الأداة، استخدم تصميم الموثق. المصدر: adaptyvbio/protein-design-skills.