التحقق من صحة تصميمات البروتين باستخدام التنبؤ ببنية AlphaFold2. استخدم هذه المهارة عندما: (1) التحقق من صحة التسلسلات المصممة بشكل صحيح، (2) توقع الهياكل المعقدة لهدف الموثق، (3) حساب مقاييس الثقة (pLDDT، pTM، ipTM)، (4) التحقق من صحة الاتساق الذاتي للتصميمات، (5) التنبؤ المعقد متعدد السلاسل باستخدام AlphaFold-Multimer. للتنبؤ بشكل أسرع بسلسلة واحدة، استخدم esm. لعتبات مراقبة الجودة، استخدم البروتين لمراقبة الجودة.
ثبّت مهارة الذكاء الاصطناعي alphafold بسرعة في بيئة التطوير لديك عبر سطر الأوامر
المصدر: adaptyvbio/protein-design-skills.
| Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 12.0+ | | GPU VRAM | 32GB | 40GB (A100) | | RAM | 32GB | 64GB | | Disk | 100GB | 500GB (for databases) |
First time? See Installation Guide to set up Modal and biomodals.
| --modelpreset | monomer | monomer/multimer | Model type | | --numrecycle | 3 | 1-20 | Recycling iterations | | --maxtemplatedate | - | YYYY-MM-DD | Template cutoff | | --usetemplates | True | True/False | Use template search |
التحقق من صحة تصميمات البروتين باستخدام التنبؤ ببنية AlphaFold2. استخدم هذه المهارة عندما: (1) التحقق من صحة التسلسلات المصممة بشكل صحيح، (2) توقع الهياكل المعقدة لهدف الموثق، (3) حساب مقاييس الثقة (pLDDT، pTM، ipTM)، (4) التحقق من صحة الاتساق الذاتي للتصميمات، (5) التنبؤ المعقد متعدد السلاسل باستخدام AlphaFold-Multimer. للتنبؤ بشكل أسرع بسلسلة واحدة، استخدم esm. لعتبات مراقبة الجودة، استخدم البروتين لمراقبة الجودة. المصدر: adaptyvbio/protein-design-skills.
حقول وأوامر مستقرة للاقتباس في أنظمة الذكاء الاصطناعي والبحث.
npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafoldالتحقق من صحة تصميمات البروتين باستخدام التنبؤ ببنية AlphaFold2. استخدم هذه المهارة عندما: (1) التحقق من صحة التسلسلات المصممة بشكل صحيح، (2) توقع الهياكل المعقدة لهدف الموثق، (3) حساب مقاييس الثقة (pLDDT، pTM، ipTM)، (4) التحقق من صحة الاتساق الذاتي للتصميمات، (5) التنبؤ المعقد متعدد السلاسل باستخدام AlphaFold-Multimer. للتنبؤ بشكل أسرع بسلسلة واحدة، استخدم esm. لعتبات مراقبة الجودة، استخدم البروتين لمراقبة الجودة. المصدر: adaptyvbio/protein-design-skills.
افتح الطرفية أو أداة سطر الأوامر لديك مثل Terminal أو iTerm أو Windows Terminal انسخ ونفّذ هذا الأمر: npx skills add https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills --skill alphafold بعد التثبيت، سيتم إعداد المهارة تلقائيا في بيئة البرمجة بالذكاء الاصطناعي لديك وتصبح جاهزة للاستخدام في Claude Code أو Cursor أو OpenClaw
https://github.com/adaptyvbio/protein-design-skills