pathml

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PathML is a comprehensive Python toolkit for computational pathology workflows, designed to facilitate machine learning and image analysis for whole-slide pathology images. The framework provides modular, composable tools for loading diverse slide formats, preprocessing images, constructing spatial graphs, training deep learning models, and analyzing multiparametric imaging data from technologies like CODEX and mu...

PathML provides six major capability areas documented in detail within reference files:

Load whole-slide images from 160+ proprietary formats including Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, Leica SCN, Zeiss ZVI, DICOM, and OME-TIFF. PathML automatically handles vendor-specific formats and provides unified interfaces for accessing image pyramids, metadata, and regions of interest.

전체 슬라이드 이미지(WSI) 및 다중 매개변수 이미징 데이터를 분석하기 위한 전산 병리학 툴킷입니다. 조직병리학 슬라이드, H&E 염색 이미지, 다중 면역형광법(CODEX, Vectra), 공간 단백질체학, 핵 검출/분할, 조직 그래프 구성 또는 병리학 데이터에 대한 ML 모델 교육 작업을 수행할 때 이 기술을 사용하십시오. 디지털 병리학 작업 흐름을 위해 Aperio SVS, NDPI, DICOM, OME-TIFF를 포함한 160개 이상의 슬라이드 형식을 지원합니다. 출처: ovachiever/droid-tings.

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