pathml

SKILL.md

PathML is a comprehensive Python toolkit for computational pathology workflows, designed to facilitate machine learning and image analysis for whole-slide pathology images. The framework provides modular, composable tools for loading diverse slide formats, preprocessing images, constructing spatial graphs, training deep learning models, and analyzing multiparametric imaging data from technologies like CODEX and mu...

PathML provides six major capability areas documented in detail within reference files:

Load whole-slide images from 160+ proprietary formats including Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, Leica SCN, Zeiss ZVI, DICOM, and OME-TIFF. PathML automatically handles vendor-specific formats and provides unified interfaces for accessing image pyramids, metadata, and regions of interest.

全スライド画像 (WSI) およびマルチパラメトリック画像データを分析するための計算病理学ツールキット。このスキルは、病理組織スライド、H&E 染色画像、多重免疫蛍光 (CODEX、Vectra)、空間プロテオミクス、核検出/セグメンテーション、組織グラフ構築、または病理学データでの ML モデルのトレーニングを操作するときに使用します。デジタルパソロジーワークフロー向けに、Aperio SVS、NDPI、DICOM、OME-TIFF を含む 160 以上のスライド形式をサポートします。 ソース: ovachiever/droid-tings。

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