複数の経路データベース (Reactome、KEGG、WikiPathways、Pathway Commons、BioModels) を使用した包括的なシステム生物学と経路解析。パスウェイエンリッチメント、タンパク質パスウェイマッピング、キーワード検索、システムレベルの分析を実行します。遺伝子セットの分析、生物学的経路の探索、またはシステムレベルの生物学の調査に使用します。
コマンドラインで tooluniverse-systems-biology AI スキルを開発環境にすばやくインストール
ソース: mims-harvard/tooluniverse。
Comprehensive pathway and systems biology analysis integrating multiple curated databases to provide multi-dimensional view of biological systems, pathway enrichment, and protein-pathway relationships.
| Reactome | Human-curated reactions & pathways | Detailed mechanistic pathways with reactions | | KEGG | Reference pathways across organisms | Metabolic maps, disease pathways, drug targets | | WikiPathways | Community-curated pathways | Emerging processes, collaborative updates |
| Pathway Commons | Integrated meta-database | Aggregates multiple sources (Reactome, KEGG, etc.) | | BioModels | Computational SBML models | Mathematical/dynamic systems biology models | | Enrichr | Statistical enrichment | Pathway over-representation analysis |
複数の経路データベース (Reactome、KEGG、WikiPathways、Pathway Commons、BioModels) を使用した包括的なシステム生物学と経路解析。パスウェイエンリッチメント、タンパク質パスウェイマッピング、キーワード検索、システムレベルの分析を実行します。遺伝子セットの分析、生物学的経路の探索、またはシステムレベルの生物学の調査に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。
AI/検索での引用用の安定したフィールドとコマンド。
npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-systems-biology複数の経路データベース (Reactome、KEGG、WikiPathways、Pathway Commons、BioModels) を使用した包括的なシステム生物学と経路解析。パスウェイエンリッチメント、タンパク質パスウェイマッピング、キーワード検索、システムレベルの分析を実行します。遺伝子セットの分析、生物学的経路の探索、またはシステムレベルの生物学の調査に使用します。 ソース: mims-harvard/tooluniverse。
ターミナルまたはコマンドラインツール（Terminal、iTerm、Windows Terminal など）を開きます このコマンドをコピーして実行します: npx skills add https://github.com/mims-harvard/tooluniverse --skill tooluniverse-systems-biology インストール後、スキルは自動的に AI コーディング環境に設定され、Claude Code、Cursor、OpenClaw で使用できるようになります
https://github.com/mims-harvard/tooluniverse