Biologia completa dei sistemi e analisi dei percorsi utilizzando più database di percorsi (Reactome, KEGG, WikiPathways, Pathway Commons, BioModels). Esegue l'arricchimento del percorso, la mappatura del percorso delle proteine, la ricerca di parole chiave e l'analisi a livello di sistema. Da utilizzare quando si analizzano set di geni, si esplorano percorsi biologici o si studia la biologia a livello di sistema.
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Fonte: mims-harvard/tooluniverse.
Comprehensive pathway and systems biology analysis integrating multiple curated databases to provide multi-dimensional view of biological systems, pathway enrichment, and protein-pathway relationships.
| Reactome | Human-curated reactions & pathways | Detailed mechanistic pathways with reactions | | KEGG | Reference pathways across organisms | Metabolic maps, disease pathways, drug targets | | WikiPathways | Community-curated pathways | Emerging processes, collaborative updates |
| Pathway Commons | Integrated meta-database | Aggregates multiple sources (Reactome, KEGG, etc.) | | BioModels | Computational SBML models | Mathematical/dynamic systems biology models | | Enrichr | Statistical enrichment | Pathway over-representation analysis |
Biologia completa dei sistemi e analisi dei percorsi utilizzando più database di percorsi (Reactome, KEGG, WikiPathways, Pathway Commons, BioModels). Esegue l'arricchimento del percorso, la mappatura del percorso delle proteine, la ricerca di parole chiave e l'analisi a livello di sistema. Da utilizzare quando si analizzano set di geni, si esplorano percorsi biologici o si studia la biologia a livello di sistema. Fonte: mims-harvard/tooluniverse.
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