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pdb-database

Interrogez et récupérez les structures de protéines/acides nucléiques à partir du RCSB PDB. À utiliser lorsque vous devez rechercher des structures ou des métadonnées dans la base de données PDB. Prend en charge les recherches basées sur du texte, des séquences et de la structure, les téléchargements de coordonnées et la récupération de métadonnées pour les flux de travail de biologie structurelle.

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Installation

$npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill pdb-database

Comment installer pdb-database

Installez rapidement le skill IA pdb-database dans votre environnement de développement via la ligne de commande

  1. Ouvrir le Terminal: Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.)
  2. Exécuter la commande d'installation: Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill pdb-database
  3. Vérifier l'installation: Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code, Cursor ou OpenClaw

Source : aminoanalytica/amina-skills.

The Protein Data Bank hosts over 200,000 experimentally determined macromolecular structures plus computed models from AlphaFold and ModelArchive. This skill provides programmatic access to search, download, and analyze structural data.

| Structure Retrieval | Download coordinates for a known PDB ID | | Similarity Search | Find structures similar by sequence or 3D fold | | Metadata Access | Get resolution, method, organism, ligands | | Dataset Building | Compile structures for ML training or analysis | | Drug Discovery | Identify ligand-bound structures for a target |

| Quality Filtering | Select high-resolution, well-refined structures |

Interrogez et récupérez les structures de protéines/acides nucléiques à partir du RCSB PDB. À utiliser lorsque vous devez rechercher des structures ou des métadonnées dans la base de données PDB. Prend en charge les recherches basées sur du texte, des séquences et de la structure, les téléchargements de coordonnées et la récupération de métadonnées pour les flux de travail de biologie structurelle. Source : aminoanalytica/amina-skills.

Faits (prêts à citer)

Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.

Commande d'installation
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill pdb-database
Catégorie
</>Développement
Vérifié
Première apparition
2026-03-06
Mis à jour
2026-03-10

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Réponses rapides

Qu'est-ce que pdb-database ?

Interrogez et récupérez les structures de protéines/acides nucléiques à partir du RCSB PDB. À utiliser lorsque vous devez rechercher des structures ou des métadonnées dans la base de données PDB. Prend en charge les recherches basées sur du texte, des séquences et de la structure, les téléchargements de coordonnées et la récupération de métadonnées pour les flux de travail de biologie structurelle. Source : aminoanalytica/amina-skills.

Comment installer pdb-database ?

Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill pdb-database Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code, Cursor ou OpenClaw

Où se trouve le dépôt source ?

https://github.com/aminoanalytica/amina-skills