pydeseq2
✓差异基因表达分析(Python DESeq2)。从批量 RNA-seq 计数、Wald 检验、FDR 校正、火山/MA 图中识别 DE 基因,以进行 RNA-seq 分析。
SKILL.md
PyDESeq2 is a Python implementation of DESeq2 for differential expression analysis with bulk RNA-seq data. Design and execute complete workflows from data loading through result interpretation, including single-factor and multi-factor designs, Wald tests with multiple testing correction, optional apeGLM shrinkage, and integration with pandas and AnnData.
For users who want to perform a standard differential expression analysis:
Important: Shrinkage affects only the log2FoldChange values, not the statistical test results (p-values remain unchanged). Use shrunk values for visualization but report unshrunken p-values for significance.
差异基因表达分析(Python DESeq2)。从批量 RNA-seq 计数、Wald 检验、FDR 校正、火山/MA 图中识别 DE 基因,以进行 RNA-seq 分析。 来源:ovachiever/droid-tings。
可引用信息
为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。
- 安装命令
npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill pydeseq2- 分类
- {}数据分析
- 认证
- ✓
- 收录时间
- 2026-02-01
- 更新时间
- 2026-02-18
快速解答
什么是 pydeseq2?
差异基因表达分析(Python DESeq2)。从批量 RNA-seq 计数、Wald 检验、FDR 校正、火山/MA 图中识别 DE 基因,以进行 RNA-seq 分析。 来源:ovachiever/droid-tings。
如何安装 pydeseq2?
打开你的终端或命令行工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 复制并运行以下命令:npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill pydeseq2 安装完成后,技能将自动配置到你的 AI 编程环境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用
这个 Skill 的源码在哪?
https://github.com/ovachiever/droid-tings
详情
- 分类
- {}数据分析
- 来源
- skills.sh
- 收录时间
- 2026-02-01