·pydeseq2
{}

pydeseq2

ovachiever/droid-tings

差异基因表达分析(Python DESeq2)。从批量 RNA-seq 计数、Wald 检验、FDR 校正、火山/MA 图中识别 DE 基因,以进行 RNA-seq 分析。

21安装·0热度·@ovachiever

安装

$npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill pydeseq2

SKILL.md

PyDESeq2 is a Python implementation of DESeq2 for differential expression analysis with bulk RNA-seq data. Design and execute complete workflows from data loading through result interpretation, including single-factor and multi-factor designs, Wald tests with multiple testing correction, optional apeGLM shrinkage, and integration with pandas and AnnData.

For users who want to perform a standard differential expression analysis:

Important: Shrinkage affects only the log2FoldChange values, not the statistical test results (p-values remain unchanged). Use shrunk values for visualization but report unshrunken p-values for significance.

差异基因表达分析(Python DESeq2)。从批量 RNA-seq 计数、Wald 检验、FDR 校正、火山/MA 图中识别 DE 基因,以进行 RNA-seq 分析。 来源:ovachiever/droid-tings。

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可引用信息

为搜索与 AI 引用准备的稳定字段与命令。

安装命令
npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill pydeseq2
分类
{}数据分析
认证
收录时间
2026-02-01
更新时间
2026-02-18

快速解答

什么是 pydeseq2?

差异基因表达分析(Python DESeq2)。从批量 RNA-seq 计数、Wald 检验、FDR 校正、火山/MA 图中识别 DE 基因,以进行 RNA-seq 分析。 来源:ovachiever/droid-tings。

如何安装 pydeseq2?

打开你的终端或命令行工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 复制并运行以下命令:npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill pydeseq2 安装完成后,技能将自动配置到你的 AI 编程环境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用

这个 Skill 的源码在哪?

https://github.com/ovachiever/droid-tings