pydeseq2
✓Differenzielle Genexpressionsanalyse (Python DESeq2). Identifizieren Sie DE-Gene aus Massen-RNA-Seq-Zählungen, Wald-Tests, FDR-Korrektur, Vulkan-/MA-Plots für die RNA-Seq-Analyse.
Installation
SKILL.md
PyDESeq2 is a Python implementation of DESeq2 for differential expression analysis with bulk RNA-seq data. Design and execute complete workflows from data loading through result interpretation, including single-factor and multi-factor designs, Wald tests with multiple testing correction, optional apeGLM shrinkage, and integration with pandas and AnnData.
For users who want to perform a standard differential expression analysis:
Important: Shrinkage affects only the log2FoldChange values, not the statistical test results (p-values remain unchanged). Use shrunk values for visualization but report unshrunken p-values for significance.
Differenzielle Genexpressionsanalyse (Python DESeq2). Identifizieren Sie DE-Gene aus Massen-RNA-Seq-Zählungen, Wald-Tests, FDR-Korrektur, Vulkan-/MA-Plots für die RNA-Seq-Analyse. Quelle: ovachiever/droid-tings.
Fakten (zitierbereit)
Stabile Felder und Befehle für KI/Such-Zitate.
- Installationsbefehl
npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill pydeseq2- Quelle
- ovachiever/droid-tings
- Kategorie
- {}Datenanalyse
- Verifiziert
- ✓
- Erstes Auftreten
- 2026-02-01
- Aktualisiert
- 2026-02-18
Schnelle Antworten
Was ist pydeseq2?
Differenzielle Genexpressionsanalyse (Python DESeq2). Identifizieren Sie DE-Gene aus Massen-RNA-Seq-Zählungen, Wald-Tests, FDR-Korrektur, Vulkan-/MA-Plots für die RNA-Seq-Analyse. Quelle: ovachiever/droid-tings.
Wie installiere ich pydeseq2?
Öffnen Sie Ihr Terminal oder Kommandozeilen-Tool (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Kopieren Sie diesen Befehl und führen Sie ihn aus: npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill pydeseq2 Nach der Installation wird der Skill automatisch in Ihrer KI-Programmierumgebung konfiguriert und ist bereit zur Verwendung in Claude Code oder Cursor
Wo ist das Quell-Repository?
https://github.com/ovachiever/droid-tings
Details
- Kategorie
- {}Datenanalyse
- Quelle
- skills.sh
- Erstes Auftreten
- 2026-02-01