·pydeseq2
{}

pydeseq2

jackspace/claudeskillz

差異基因表現分析(Python DESeq2)。從批量 RNA-seq 計數、Wald 檢定、FDR 校正、火山/MA 圖中識別 DE 基因,以進行 RNA-seq 分析。

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安裝

$npx skills add https://github.com/jackspace/claudeskillz --skill pydeseq2

SKILL.md

PyDESeq2 is a Python implementation of DESeq2 for differential expression analysis with bulk RNA-seq data. Design and execute complete workflows from data loading through result interpretation, including single-factor and multi-factor designs, Wald tests with multiple testing correction, optional apeGLM shrinkage, and integration with pandas and AnnData.

For users who want to perform a standard differential expression analysis:

Important: Shrinkage affects only the log2FoldChange values, not the statistical test results (p-values remain unchanged). Use shrunk values for visualization but report unshrunken p-values for significance.

差異基因表現分析(Python DESeq2)。從批量 RNA-seq 計數、Wald 檢定、FDR 校正、火山/MA 圖中識別 DE 基因,以進行 RNA-seq 分析。 來源:jackspace/claudeskillz。

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可引用資訊

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安裝指令
npx skills add https://github.com/jackspace/claudeskillz --skill pydeseq2
分類
{}資料分析
認證
收錄時間
2026-02-17
更新時間
2026-02-18

快速解答

什麼是 pydeseq2?

差異基因表現分析(Python DESeq2)。從批量 RNA-seq 計數、Wald 檢定、FDR 校正、火山/MA 圖中識別 DE 基因,以進行 RNA-seq 分析。 來源:jackspace/claudeskillz。

如何安裝 pydeseq2?

開啟你的終端機或命令列工具(如 Terminal、iTerm、Windows Terminal 等) 複製並執行以下指令:npx skills add https://github.com/jackspace/claudeskillz --skill pydeseq2 安裝完成後,技能將自動設定到你的 AI 程式設計環境中,可以在 Claude Code 或 Cursor 中使用

這個 Skill 的原始碼在哪?

https://github.com/jackspace/claudeskillz