Создавайте воспроизводимую документацию по методам на основе артефактов выполнения рабочего процесса (Nextflow/Snakemake/CWL), включая точные команды, версии, параметры, элементы контроля качества и выходные данные.
Быстро установите AI-навык bio-workflow-methods-docwriter в вашу среду разработки через командную строку
Источник: fmschulz/omics-skills.
Create publication-ready Methods and run documentation from real workflow artifacts.
| Evidence checklist | See reference/evidence-checklist.md | | Manifest schema | schemas/run-manifest.schema.json | | Validate manifest | python scripts/validaterunmanifest.py runmanifest.yaml | | Examples | See examples/ |
Issue: Missing tool versions in logs Solution: Mark as NOT CAPTURED and add a note on how to capture next time.
Создавайте воспроизводимую документацию по методам на основе артефактов выполнения рабочего процесса (Nextflow/Snakemake/CWL), включая точные команды, версии, параметры, элементы контроля качества и выходные данные. Источник: fmschulz/omics-skills.
Стабильные поля и команды для ссылок в AI/поиске.
npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-workflow-methods-docwriterСоздавайте воспроизводимую документацию по методам на основе артефактов выполнения рабочего процесса (Nextflow/Snakemake/CWL), включая точные команды, версии, параметры, элементы контроля качества и выходные данные. Источник: fmschulz/omics-skills.
Откройте терминал или инструмент командной строки (Terminal, iTerm, Windows Terminal и т.д.) Скопируйте и выполните эту команду: npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-workflow-methods-docwriter После установки навык будет автоматически настроен в вашей AI-среде разработки и готов к использованию в Claude Code, Cursor или OpenClaw
https://github.com/fmschulz/omics-skills