Générez une documentation reproductible sur les méthodes à partir des artefacts d'exécution de flux de travail (Nextflow/Snakemake/CWL), y compris les commandes, versions, paramètres, portes QC et sorties exactes.
Installez rapidement le skill IA bio-workflow-methods-docwriter dans votre environnement de développement via la ligne de commande
Source : fmschulz/omics-skills.
Create publication-ready Methods and run documentation from real workflow artifacts.
| Evidence checklist | See reference/evidence-checklist.md | | Manifest schema | schemas/run-manifest.schema.json | | Validate manifest | python scripts/validaterunmanifest.py runmanifest.yaml | | Examples | See examples/ |
Issue: Missing tool versions in logs Solution: Mark as NOT CAPTURED and add a note on how to capture next time.
Générez une documentation reproductible sur les méthodes à partir des artefacts d'exécution de flux de travail (Nextflow/Snakemake/CWL), y compris les commandes, versions, paramètres, portes QC et sorties exactes. Source : fmschulz/omics-skills.
Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.
npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-workflow-methods-docwriterGénérez une documentation reproductible sur les méthodes à partir des artefacts d'exécution de flux de travail (Nextflow/Snakemake/CWL), y compris les commandes, versions, paramètres, portes QC et sorties exactes. Source : fmschulz/omics-skills.
Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-workflow-methods-docwriter Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code, Cursor ou OpenClaw
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