nextflow-development

SKILL.md

Run nf-core bioinformatics pipelines on local or public sequencing data.

Target users: Bench scientists and researchers without specialized bioinformatics training who need to run large-scale omics analyses—differential expression, variant calling, or chromatin accessibility analysis.

For public datasets, fetch from GEO/SRA first. See references/geo-sra-acquisition.md for the full workflow.

シーケンス データに対して nf-core バイオインフォマティクス パイプライン (rnaseq、sarek、atacseq) を実行します。 RNA-seq、WGS/WES、または ATAC-seq データ（ローカル FASTQ または GEO/SRA の公開データセット）を分析する場合に使用します。 nf コア、Nextflow、FASTQ 分析、バリアント呼び出し、遺伝子発現、差次的発現、GEO 再分析、GSE/GSM/SRR アクセッション、またはサンプルシート作成でトリガーされます。 ソース: anthropics/life-sciences。

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