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bio-prefect-dask-nextflow

Progetta e supporta pipeline bioinformatiche utilizzando Prefect+Dask per l'esecuzione locale/distribuita o Nextflow per pianificatori HPC.

9Installazioni·1Tendenza·@fmschulz

Installazione

$npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow

Come installare bio-prefect-dask-nextflow

Installa rapidamente la skill AI bio-prefect-dask-nextflow nel tuo ambiente di sviluppo tramite riga di comando

  1. Apri il terminale: Apri il tuo terminale o strumento da riga di comando (Terminal, iTerm, Windows Terminal, ecc.)
  2. Esegui il comando di installazione: Copia ed esegui questo comando: npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow
  3. Verifica l'installazione: Dopo l'installazione, la skill verrà configurata automaticamente nel tuo ambiente AI di coding e sarà pronta all'uso in Claude Code, Cursor o OpenClaw

Fonte: fmschulz/omics-skills.

Choose and scaffold the right workflow engine for local, distributed, or HPC bioinformatics pipelines.

| Engine choice | See decision-matrix.md | | Prefect+Dask scaffold | See prefect-dask.md | | Prefect on Slurm | See prefect-hpc-slurm.md | | Nextflow on HPC | See nextflow-hpc.md | | Examples | See examples.md |

Issue: Workflow fails on HPC due to environment mismatch Solution: Pin container/conda versions and validate with a minimal test dataset.

Progetta e supporta pipeline bioinformatiche utilizzando Prefect+Dask per l'esecuzione locale/distribuita o Nextflow per pianificatori HPC. Fonte: fmschulz/omics-skills.

Fatti (pronti per citazione)

Campi e comandi stabili per citazioni AI/ricerca.

Comando di installazione
npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow
Categoria
</>Sviluppo
Verificato
Prima apparizione
2026-02-26
Aggiornato
2026-03-10

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Risposte rapide

Che cos'è bio-prefect-dask-nextflow?

Progetta e supporta pipeline bioinformatiche utilizzando Prefect+Dask per l'esecuzione locale/distribuita o Nextflow per pianificatori HPC. Fonte: fmschulz/omics-skills.

Come installo bio-prefect-dask-nextflow?

Apri il tuo terminale o strumento da riga di comando (Terminal, iTerm, Windows Terminal, ecc.) Copia ed esegui questo comando: npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow Dopo l'installazione, la skill verrà configurata automaticamente nel tuo ambiente AI di coding e sarà pronta all'uso in Claude Code, Cursor o OpenClaw

Dov'è il repository sorgente?

https://github.com/fmschulz/omics-skills