Qu'est-ce que bio-prefect-dask-nextflow ?
Concevez et échafaudez des pipelines bioinformatiques à l'aide de Prefect+Dask pour une exécution locale/distribuée ou de Nextflow pour les planificateurs HPC. Source : fmschulz/omics-skills.
Concevez et échafaudez des pipelines bioinformatiques à l'aide de Prefect+Dask pour une exécution locale/distribuée ou de Nextflow pour les planificateurs HPC.
Installez rapidement le skill IA bio-prefect-dask-nextflow dans votre environnement de développement via la ligne de commande
Source : fmschulz/omics-skills.
Choose and scaffold the right workflow engine for local, distributed, or HPC bioinformatics pipelines.
| Engine choice | See decision-matrix.md | | Prefect+Dask scaffold | See prefect-dask.md | | Prefect on Slurm | See prefect-hpc-slurm.md | | Nextflow on HPC | See nextflow-hpc.md | | Examples | See examples.md |
Issue: Workflow fails on HPC due to environment mismatch Solution: Pin container/conda versions and validate with a minimal test dataset.
Concevez et échafaudez des pipelines bioinformatiques à l'aide de Prefect+Dask pour une exécution locale/distribuée ou de Nextflow pour les planificateurs HPC. Source : fmschulz/omics-skills.
Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.
npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflowConcevez et échafaudez des pipelines bioinformatiques à l'aide de Prefect+Dask pour une exécution locale/distribuée ou de Nextflow pour les planificateurs HPC. Source : fmschulz/omics-skills.
Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code, Cursor ou OpenClaw
https://github.com/fmschulz/omics-skills