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bio-prefect-dask-nextflow

Concevez et échafaudez des pipelines bioinformatiques à l'aide de Prefect+Dask pour une exécution locale/distribuée ou de Nextflow pour les planificateurs HPC.

9Installations·1Tendance·@fmschulz

Installation

$npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow

Comment installer bio-prefect-dask-nextflow

Installez rapidement le skill IA bio-prefect-dask-nextflow dans votre environnement de développement via la ligne de commande

  1. Ouvrir le Terminal: Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.)
  2. Exécuter la commande d'installation: Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow
  3. Vérifier l'installation: Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code, Cursor ou OpenClaw

Source : fmschulz/omics-skills.

Choose and scaffold the right workflow engine for local, distributed, or HPC bioinformatics pipelines.

| Engine choice | See decision-matrix.md | | Prefect+Dask scaffold | See prefect-dask.md | | Prefect on Slurm | See prefect-hpc-slurm.md | | Nextflow on HPC | See nextflow-hpc.md | | Examples | See examples.md |

Issue: Workflow fails on HPC due to environment mismatch Solution: Pin container/conda versions and validate with a minimal test dataset.

Concevez et échafaudez des pipelines bioinformatiques à l'aide de Prefect+Dask pour une exécution locale/distribuée ou de Nextflow pour les planificateurs HPC. Source : fmschulz/omics-skills.

Faits (prêts à citer)

Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.

Commande d'installation
npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow
Catégorie
</>Développement
Vérifié
Première apparition
2026-02-26
Mis à jour
2026-03-10

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Réponses rapides

Qu'est-ce que bio-prefect-dask-nextflow ?

Concevez et échafaudez des pipelines bioinformatiques à l'aide de Prefect+Dask pour une exécution locale/distribuée ou de Nextflow pour les planificateurs HPC. Source : fmschulz/omics-skills.

Comment installer bio-prefect-dask-nextflow ?

Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/fmschulz/omics-skills --skill bio-prefect-dask-nextflow Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code, Cursor ou OpenClaw

Où se trouve le dépôt source ?

https://github.com/fmschulz/omics-skills