Conseils de pipeline validés par domaine pour l'analyse des données d'imagerie calcique : correction de mouvement, extraction du retour sur investissement, correction des neuropils, inférence de pointes et contrôle qualité
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Source : haoxuanlithuai/awesome_cognitive_and_neuroscience_skills.
This skill encodes expert methodological knowledge for analyzing calcium imaging data from fluorescent genetically encoded calcium indicators (GECIs). It covers the domain-specific decisions that a general-purpose programmer or data scientist would get wrong without specialized training in optical neurophysiology: choosing deconvolution parameters based on indicator kinetics, correcting neuropil contamination, han...
This skill was generated by AI from academic literature. All parameters, thresholds, and citations require independent verification before use in research. If you find errors, please open an issue.
Motion correction must precede all other analysis. Uncorrected motion creates false transients and blurs cellular signals.
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npx skills add https://github.com/haoxuanlithuai/awesome_cognitive_and_neuroscience_skills --skill calcium imaging analysis guideBrowse more skills from haoxuanlithuai/awesome_cognitive_and_neuroscience_skills
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Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/haoxuanlithuai/awesome_cognitive_and_neuroscience_skills --skill calcium imaging analysis guide Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code, Cursor ou OpenClaw
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