This skill enables Claude Code to control PyMOL molecular visualization software through the claudemol socket interface. It supports:
| Setup | Install PyMOL, configure claudemol, verify connection | | Structure Loading | Load PDB files, fetch from RCSB, open local structures | | Representations | Cartoon, surface, sticks, spheres, ribbons, lines | | Coloring | Color by chain, spectrum, B-factor, custom colors | | Selections | Select residues, chains, ligands, binding sites |
| Camera | Orient view, zoom, rotate, save viewpoints | | Ray Tracing | High-quality renders, publication figures | | Export | Save images (PNG), sessions (PSE), movies |
السيطرة على التصور الجزيئي PyMOL من خلال كود كلود. يُستخدم عندما يُطلب منك "تصور البروتين"، أو "تقديم البنية"، أو "إظهار الرسوم المتحركة"، أو "اللون حسب السلسلة"، أو "تتبع الشعاع"، أو "إعداد البيمول"، أو "تثبيت البيمول"، أو العمل مع الرسومات الجزيئية. يتعامل مع الإعداد، وأوامر التصور، وتوليد الشكل بجودة النشر. المصدر: aminoanalytica/amina-skills.