·arboreto

확장 가능한 알고리즘(GRNBoost2, GENIE3)을 사용하여 유전자 발현 데이터에서 유전자 조절 네트워크(GRN)를 추론합니다. 전사 인자-표적 유전자 관계 및 조절 상호작용을 식별하기 위해 전사체학 데이터(대량 RNA-seq, 단일 세포 RNA-seq)를 분석할 때 사용합니다. 대규모 데이터 세트에 대한 분산 계산을 지원합니다.

6설치·0트렌드·@microck

설치

$npx skills add https://github.com/microck/ordinary-claude-skills --skill arboreto

SKILL.md

Arboreto is a computational library for inferring gene regulatory networks (GRNs) from gene expression data using parallelized algorithms that scale from single machines to multi-node clusters.

Core capability: Identify which transcription factors (TFs) regulate which target genes based on expression patterns across observations (cells, samples, conditions).

Critical: Always use if name == 'main': guard because Dask spawns new processes.

확장 가능한 알고리즘(GRNBoost2, GENIE3)을 사용하여 유전자 발현 데이터에서 유전자 조절 네트워크(GRN)를 추론합니다. 전사 인자-표적 유전자 관계 및 조절 상호작용을 식별하기 위해 전사체학 데이터(대량 RNA-seq, 단일 세포 RNA-seq)를 분석할 때 사용합니다. 대규모 데이터 세트에 대한 분산 계산을 지원합니다. 출처: microck/ordinary-claude-skills.

원본 보기

인용 가능한 정보

AI/검색 인용용 안정적인 필드와 명령어.

설치 명령어
npx skills add https://github.com/microck/ordinary-claude-skills --skill arboreto
카테고리
{}데이터 분석
인증됨
최초 등록
2026-02-01
업데이트
2026-02-18

빠른 답변

arboreto이란?

확장 가능한 알고리즘(GRNBoost2, GENIE3)을 사용하여 유전자 발현 데이터에서 유전자 조절 네트워크(GRN)를 추론합니다. 전사 인자-표적 유전자 관계 및 조절 상호작용을 식별하기 위해 전사체학 데이터(대량 RNA-seq, 단일 세포 RNA-seq)를 분석할 때 사용합니다. 대규모 데이터 세트에 대한 분산 계산을 지원합니다. 출처: microck/ordinary-claude-skills.

arboreto 설치 방법은?

터미널 또는 명령줄 도구(Terminal, iTerm, Windows Terminal 등)를 엽니다 이 명령어를 복사하여 실행합니다: npx skills add https://github.com/microck/ordinary-claude-skills --skill arboreto 설치 후 스킬은 자동으로 AI 코딩 환경에 설정되어 Claude Code나 Cursor에서 사용할 수 있습니다

소스 저장소는 어디인가요?

https://github.com/microck/ordinary-claude-skills