Toolkit Python per la biologia computazionale. Utilizzare quando viene richiesto di "analizzare FASTA", "leggere GenBank", "interrogare NCBI", "eseguire BLAST", "analizzare la struttura delle proteine", "costruire un albero filogenetico" o lavorare con sequenze biologiche. Gestisce l'I/O della sequenza, l'accesso al database, gli allineamenti, l'analisi della struttura e la filogenetica.
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Fonte: aminoanalytica/amina-skills.
Biopython (v1.85+) delivers a comprehensive Python library for biological data analysis. It requires Python 3 and NumPy, providing modular components for sequences, alignments, database access, BLAST, structures, and phylogenetics.
| Sequence Operations | Create, modify, translate DNA/RNA/protein sequences | | File Format Handling | Parse or convert FASTA, GenBank, FASTQ, PDB, mmCIF | | NCBI Database Access | Query GenBank, PubMed, Protein, Gene, Taxonomy | | Similarity Searches | Execute BLAST locally or via NCBI, parse results |
| Alignment Work | Pairwise or multiple sequence alignments | | Structural Analysis | Parse PDB files, compute distances, DSSP assignment | | Tree Construction | Build, manipulate, visualize phylogenetic trees | | Motif Discovery | Find and score sequence patterns | | Sequence Statistics | GC content, molecular weight, melting temperature |
Campi e comandi stabili per citazioni AI/ricerca.
npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill biopythonToolkit Python per la biologia computazionale. Utilizzare quando viene richiesto di "analizzare FASTA", "leggere GenBank", "interrogare NCBI", "eseguire BLAST", "analizzare la struttura delle proteine", "costruire un albero filogenetico" o lavorare con sequenze biologiche. Gestisce l'I/O della sequenza, l'accesso al database, gli allineamenti, l'analisi della struttura e la filogenetica. Fonte: aminoanalytica/amina-skills.
Apri il tuo terminale o strumento da riga di comando (Terminal, iTerm, Windows Terminal, ecc.) Copia ed esegui questo comando: npx skills add https://github.com/aminoanalytica/amina-skills --skill biopython Dopo l'installazione, la skill verrà configurata automaticamente nel tuo ambiente AI di coding e sarà pronta all'uso in Claude Code, Cursor o OpenClaw
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