什么是 scvi-tools?
使用 scvi-tools 进行单细胞分析的深度学习。当用户需要 (1) 使用 scVI/scANVI 进行数据集成和批量校正、(2) 使用 PeakVI 进行 ATAC-seq 分析、(3) 使用 TotalVI 进行 CITE-seq 多模态分析、(4) 使用 MultiVI 进行多组 RNA+ATAC 分析、(5) 使用 DestVI 进行空间转录组解卷积、(6) 使用 scANVI/scArches 进行标签转移和参考映射、(7) 使用 veloVI 进行 RNA 速度或 (8) 任何基于深度学习的功能时,应使用此技能单细胞方法。触发因素包括提及 scVI、scANVI、totalVI、PeakVI、MultiVI、DestVI、veloVI、sysVI、scArches、变分自动编码器、VAE、批量校正、数据集成、多模态、CITE-seq、多组、参考映射、潜在空间。 来源:anthropics/knowledge-work-plugins。