arboreto
✓Déduire des réseaux de régulation génique (GRN) à partir des données d’expression génique à l’aide d’algorithmes évolutifs (GRNBoost2, GENIE3). À utiliser lors de l'analyse de données transcriptomiques (ARN-seq en masse, ARN-seq unicellulaire) pour identifier les relations entre les facteurs de transcription et les gènes cibles et les interactions régulatrices. Prend en charge le calcul distribué pour les ensembles de données à grande échelle.
Installation
SKILL.md
Arboreto is a computational library for inferring gene regulatory networks (GRNs) from gene expression data using parallelized algorithms that scale from single machines to multi-node clusters.
Core capability: Identify which transcription factors (TFs) regulate which target genes based on expression patterns across observations (cells, samples, conditions).
Critical: Always use if name == 'main': guard because Dask spawns new processes.
Déduire des réseaux de régulation génique (GRN) à partir des données d’expression génique à l’aide d’algorithmes évolutifs (GRNBoost2, GENIE3). À utiliser lors de l'analyse de données transcriptomiques (ARN-seq en masse, ARN-seq unicellulaire) pour identifier les relations entre les facteurs de transcription et les gènes cibles et les interactions régulatrices. Prend en charge le calcul distribué pour les ensembles de données à grande échelle. Source : ovachiever/droid-tings.
Faits (prêts à citer)
Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.
- Commande d'installation
npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill arboreto- Source
- ovachiever/droid-tings
- Catégorie
- {}Analyse de Données
- Vérifié
- ✓
- Première apparition
- 2026-02-01
- Mis à jour
- 2026-02-18
Réponses rapides
Qu'est-ce que arboreto ?
Déduire des réseaux de régulation génique (GRN) à partir des données d’expression génique à l’aide d’algorithmes évolutifs (GRNBoost2, GENIE3). À utiliser lors de l'analyse de données transcriptomiques (ARN-seq en masse, ARN-seq unicellulaire) pour identifier les relations entre les facteurs de transcription et les gènes cibles et les interactions régulatrices. Prend en charge le calcul distribué pour les ensembles de données à grande échelle. Source : ovachiever/droid-tings.
Comment installer arboreto ?
Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/ovachiever/droid-tings --skill arboreto Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code ou Cursor
Où se trouve le dépôt source ?
https://github.com/ovachiever/droid-tings
Détails
- Catégorie
- {}Analyse de Données
- Source
- skills.sh
- Première apparition
- 2026-02-01