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biopython

jackspace/claudeskillz

Boîte à outils Python primaire pour la biologie moléculaire. Préféré pour les requêtes PubMed/NCBI basées sur Python (Bio.Entrez), la manipulation de séquences, l'analyse de fichiers (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), les flux de travail BLAST avancés, les structures, la phylogénétique. Pour un BLAST rapide, utilisez gget. Pour l'API REST directe, utilisez pubmed-database.

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Installation

$npx skills add https://github.com/jackspace/claudeskillz --skill biopython

SKILL.md

Biopython is a comprehensive set of freely available Python tools for biological computation. It provides functionality for sequence manipulation, file I/O, database access, structural bioinformatics, phylogenetics, and many other bioinformatics tasks. The current version is Biopython 1.85 (released January 2025), which supports Python 3 and requires NumPy.

Biopython is organized into modular sub-packages, each addressing specific bioinformatics domains:

For NCBI database access, always set your email address (required by NCBI):

Boîte à outils Python primaire pour la biologie moléculaire. Préféré pour les requêtes PubMed/NCBI basées sur Python (Bio.Entrez), la manipulation de séquences, l'analyse de fichiers (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), les flux de travail BLAST avancés, les structures, la phylogénétique. Pour un BLAST rapide, utilisez gget. Pour l'API REST directe, utilisez pubmed-database. Source : jackspace/claudeskillz.

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Faits (prêts à citer)

Champs et commandes stables pour les citations IA/recherche.

Commande d'installation
npx skills add https://github.com/jackspace/claudeskillz --skill biopython
Catégorie
</>Développement
Vérifié
Première apparition
2026-02-17
Mis à jour
2026-02-18

Réponses rapides

Qu'est-ce que biopython ?

Boîte à outils Python primaire pour la biologie moléculaire. Préféré pour les requêtes PubMed/NCBI basées sur Python (Bio.Entrez), la manipulation de séquences, l'analyse de fichiers (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), les flux de travail BLAST avancés, les structures, la phylogénétique. Pour un BLAST rapide, utilisez gget. Pour l'API REST directe, utilisez pubmed-database. Source : jackspace/claudeskillz.

Comment installer biopython ?

Ouvrez votre terminal ou outil de ligne de commande (Terminal, iTerm, Windows Terminal, etc.) Copiez et exécutez cette commande : npx skills add https://github.com/jackspace/claudeskillz --skill biopython Une fois installé, le skill sera automatiquement configuré dans votre environnement de programmation IA et prêt à être utilisé dans Claude Code ou Cursor

Où se trouve le dépôt source ?

https://github.com/jackspace/claudeskillz