scvi-tools

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scvi-tools is a comprehensive Python framework for probabilistic models in single-cell genomics. Built on PyTorch and PyTorch Lightning, it provides deep generative models using variational inference for analyzing diverse single-cell data modalities.

Single-Cell RNA-seq Analysis Core models for expression analysis, batch correction, and integration. See references/models-scrna-seq.md for:

Chromatin Accessibility (ATAC-seq) Models for analyzing single-cell chromatin data. See references/models-atac-seq.md for:

Diese Fähigkeit sollte bei der Arbeit mit der Einzelzell-Omics-Datenanalyse mithilfe von scvi-tools verwendet werden, einschließlich scRNA-seq, scATAC-seq, CITE-seq, räumlicher Transkriptomik und anderen Einzelzellmodalitäten. Nutzen Sie diese Fertigkeit für probabilistische Modellierung, Stapelkorrektur, Dimensionsreduktion, Differentialausdruck, Zelltypanmerkung, multimodale Integration und räumliche Analyseaufgaben. Quelle: microck/ordinary-claude-skills.

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